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沈阳药科大学开设的专业有：药学、药学(日语强化班)(5年制)、药学(英语强化班)(5年制)、药物制剂、药物分析、生物工程、临床药学、生物制药、生物制药（生命基地班）、中药资源与开发、中药制药、中药学(日语强化班)、中药学、应用化学、制药工程、环境科学、药物化学、食品质量与安全、葡萄与葡萄酒工程、食品科学与工程、药事管理、市场营销、工商管理、医疗产品管理、生物医学工程、生物医学工程（中外合作办学）、药学(理科基地班)等。
国家级级特色专业：5个：药学、制药工程、药物制剂、中药学、生物工程。
省级(直辖市)级特色专业：2个：应用化学、市场营销。
省重点、培育专业级特色专业：2个：中药学、生物工程。
学校目前已发展成为多学科、多层次、多形式教育的高等药学学府，设有药学院、制药工程学院、中药学院、生命科学与生物制药学院、工商管理学院、医疗器械学院、功能食品与葡萄酒学院、无涯创新学院、临床药学院、文体学院、马克思主义学院、国际交流学院、继续教育学院等13个学院。目前在校研究生5868人(博士生854人，硕士生5014人)、本科生10829人、成人函授生8208人。学校荟萃了众多的专家学者，教职工1331人，正高级职称178人，副高级职称322人。现有中国工程院院士1人，国家杰出青年科学基金获得者1人，全国创新争先奖状1人，国家高层次人才特殊支持计划科技创新领军人才2人，“长江学者奖励计划”特聘教授3人，“百千万人才工程”国家级人选4人，科技部中青年科技创新领军人才1人，国家高层次人才特殊支持计划青年拔尖人才1人，“长江学者奖励计划”青年学者4人，国家级教学名师1人，全国模范教师2人，全国教材建设先进个人1人，教育部新世纪优秀人才支持计划入选者1人，国务院学位委员会药学学科评议组成员1人，全国药学专业学位教指委委员1人，国家有突出贡献的中青年专家2人，霍英东青年教师奖励获得者8人，国务院特殊津贴获得者28人，教育部首届青年教师奖1人，全国优秀科技工作者1人，教育部科学研究优秀成果奖（自然科学和工程技术）青年奖1人，教育部创新团队1个，辽宁省首批领军人才1人，辽宁省优秀专家8人，辽宁省攀登学者6人，辽宁省特聘教授21人，辽宁省“院士后备人选培养工程”第二批人选1人，辽宁省优秀教师11人，辽宁省教学名师44人，辽宁省百千万人才工程百层次人选43人，“兴辽英才计划”领军人才17人、教学名师3人、青年拔尖人才22人、科技创新团队1人、高水平创新创业团队4个，辽宁省高校黄大年式教师团队3个。
学校瞄准大健康产业发展需求，坚持问题导向，加强原创性、引领性科技攻关，在创新药物设计与发现、智能药物递送系统开发、药物筛选和活性评价、药物分析新技术与新方法、中药资源开发与利用、药品监管科学研究等领域取得长足进步，粉体学、前药自组装纳米制剂、淋巴递送和示踪剂、国际化药品质量标准研究、脑科学和药物遗传学研究、毒理代谢、计算机辅助药物设计等多领域处于国际领先技术水平，先后获得国家科技进步奖一等奖1项、二等奖3项，技术发明奖三等奖1项，全国创新争先奖1项；获得新药证书137个，其中一类新药证书10个。改革开放以来，学校累计与企事业单位签订技术合同5300余项，合同额20.2亿元，其中合同额超亿元重大成果6项，帮助医药行业增加产值数百亿元。学校联合地方政府、科研院所、制药企业，共同构建沈阳药科大学科技园、辽宁省生物医药科技成果转化和技术转移基地、辽宁省高等学校现代制药产业技术研究院和辽宁省技术转移示范机构等产学研合作平台，实现科技成果与创新人才的有效供给。牵头成立国家创新药物产学研战略联盟、辽宁省现代制药产业校企联盟，成员单位超过100家。
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