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蚌埠医科大学开设的专业有：应用统计学、预防医学、食品卫生与营养学、制药工程、物联网工程、食品质量与安全、临床医学、康复治疗学、麻醉学、生物科学、生物技术、生物医学科学、信息管理与信息系统、医学信息工程、健康服务与管理、药学、药物分析、临床药学、医学影像技术、医学影像学、智能医学工程、精神医学、应用心理学、护理学、口腔医学等。
省级(直辖市)级特色专业：4个：医学影像学、生物科学、预防医学、食品卫生与营养学。
1958年7月，为加快安徽省教育卫生事业的发展，积极培养我省医务干部，国家决定由原上海第二医学院（现上海交通大学医学院）和安徽医学院（现安徽医科大学）援建创立蚌埠医学院。2023年11月，经教育部批准，学校更名为蚌埠医科大学。
学校人才培养质量一直保持较高水平。2012年以来，学校连续8届晋级全国高等医学院校大学生临床技能竞赛总决赛，荣获一等奖1次、二等奖5次、三等奖2次。2021年，学校临床医学、护理学双双荣获“第十届中国大学生医学技术技能大赛”全国总决赛银奖。2024年，在中国国际大学生创新大赛和第十届全国大学生物理实验竞赛中分别首次获得国家级铜奖和国家级一等奖，实现了我校在这两项全国性A类赛事上的历史性突破。生命科学竞赛获国赛一等奖4项，一等奖数量和推荐国赛数量连续六年排在全省第一。学校医学专业覆盖面广，专业与就业岗位吻合度高，毕业生以“理论基础实、动手能力强、发展后劲足”深受用人单位欢迎，毕业生就业率位居安徽省前列。
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