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牡丹江医科大学开设的专业有：药物制剂、制药工程、药学、生物医学工程、医学影像技术、医学影像学、卫生检验与检疫、预防医学、应用心理学、市场营销、公共事业管理、健康服务与管理、物流管理、信息管理与信息系统、护理学、口腔医学。
省级(直辖市)级特色专业：1个：医学影像学。
省重点、培育专业级特色专业：4个：医学影像学、临床医学、麻醉学、医学检验。
牡丹江医学院是黑龙江省东南部地区唯一一所省属普通本科医药院校，坐落于黑龙江省东南部重要的中心城市和风景旅游城市——牡丹江市。学校历史溯源于1946年始建的牡丹江专区医院和1956年始建的黑龙江省卫生干部进修学校，1958年创建牡丹江医学院，著名历史学家郭沫若先生题写了校名。
建校以来，学校共培养医学、药学等专业毕业生7万余人，大部分已成为基层医疗卫生事业现代化建设与发展的重要人才源，为黑龙江省和全国医药卫生事业发展作出了重要贡献。
