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南京中医药大学开设的专业有：中药资源与开发、中药学、中药制药、食品质量与安全(中外合作办学)、生物制药(中外合作办学)、药学、制药工程、药物制剂、生物制药、食品质量与安全、英语、大数据管理与应用、市场营销、公共事业管理、国际经济与贸易、劳动与社会保障、药事管理、健康服务与管理、信息管理与信息系统、康复治疗学（中外合作办学）、康复治疗学、中医康复学、针灸推拿学、食品卫生与营养学、中医养生学、中医学(农村订单定向)、中西医临床医学、计算机科学与技术、软件工程、医学信息工程、人工智能、中医学(九年制)、眼视光学、中医学(八年制)、中医学(五年制)、中医学(本博连读九年制)、应用心理学、临床医学、生物技术、助产学、护理学、康复治疗学（老年康复）、护理学（老年护理）、临床医学（老年医学）、养老服务管理。
国家级级特色专业：2个：中药资源与开发、中药学。
省级(直辖市)级特色专业：6个：针灸推拿学、护理学、中药学、中药资源与开发、公共事业管理、国际经济与贸易。
省重点、培育专业级特色专业：5个：中药学类(中药学、中药制药、中药资源与开发)、药学类(药学、药物制剂)、护理学、公共管理类(公共事业管理、劳动与社会保障)、中医学。
南京中医药大学创建于1954年，是全国建校最早的高等中医药院校之一，是江苏省人民政府与国家中医药管理局共建高校, 学校于2017年入围国家“双一流”建设高校和江苏高水平大学建设高校，2018年成为教育部和江苏省共建“双一流”建设高校。建校之初，学校即为新中国高等中医药教育培养输送了第一批师资，编撰、制订了第一套教材和教学大纲，为新中国高等中医药教育模式的确立和推广作出了开创性贡献，被誉为中国“高等中医教育的摇篮”。
学校坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的古都南京，拥有仙林、汉中门和泰州三个校区。现有各类在校生2万余名，有33个本科专业，涉及医、管、理、工、经、文6个学科门类，形成了以中医药为主体、中西医结合、多学科支撑协调发展的办学格局。
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