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皖南医学院开设的专业有：制药工程、药物制剂、药学、中药学、临床药学、公共事业管理（卫生事业管理方向）、应用心理学、法学、保险学、信息管理与信息系统、医学信息工程、智能医学工程、医学影像技术、医学影像学、生物医学工程、食品卫生与营养学、预防医学、护理学、助产学、卫生检验与检疫、医学检验技术、临床医学、康复治疗学、法医学、口腔医学、麻醉学。
国家级级特色专业：1个：法医学。
省级(直辖市)级特色专业：9个：法学、护理学、医学检验技术、医学影像学、临床医学、口腔医学、法医学、预防医学、麻醉学。
皖南医学院地处有着“长江巨埠、皖之中坚”美誉的安徽省域副中心城市——芜湖市。学校建于1958年，时为芜湖医学专科学校；1970年并入安徽医学院，1971年建立安徽医学院皖南分院；1974年经国务院批准独立建校，命名为皖南医学院；1981年获得国务院学位委员会学士学位和硕士学位授予权；1998年一次性通过教育部本科教学工作合格评价；2008年顺利通过教育部本科教学工作水平评估并获优秀等级；2018年顺利通过教育部本科教学工作审核评估；2020年通过临床医学专业认证，有效期六年。学校目前为安徽省重点支持立项建设博士学位授予单位。
学校高度重视对外交流与合作，坚持开放办学战略，与美国、德国、英国、马来西亚等国家和香港、台湾地区的10余所院校建立了校际联系与合作，签署11个框架性合作协议。近年来，选派200余名教职医护员工赴国（境）外参加学术交流、进修、访学、培训等，组织300余名学生出国（境）交流学习。自2021年起招收多个国家的留学生攻读硕士学位。学校作为芜湖市人民城市建设合伙人，深化长期战略友好合作伙伴关系；与芜湖、宣城、马鞍山等市人民政府签订市校战略合作协议，共建高水平大学。
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