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山东中医药大学开设的专业有：康复物理治疗、康复治疗学、听力与言语康复学、中医康复学、运动康复、康复作业治疗、运动人体科学、药物制剂、药学、中草药栽培与鉴定、中药资源与开发、中药学、制药工程、劳动与社会保障、法学、公共事业管理、信息管理与信息系统、市场营销、社会体育指导与管理、健康服务与管理、应用心理学、食品卫生与营养学、中医养生学、数据科学与大数据技术、智能医学工程、计算机科学与技术、生物医学工程、眼视光学、临床医学(中西医结合)、眼视光医学、中医学、中西医临床医学、中医学（“5+3”一体化、针灸推拿学方向）、针灸推拿学、眼视光学(中美双学位)、护理学、英语等。
国家级级特色专业：4个：中医学、中药学、针灸推拿学、制药工程。
省级(直辖市)级特色专业：8个：中西医临床医学、中草药栽培与鉴定、护理学、康复治疗学、应用心理学、眼视光学、信息管理与信息系统、眼视光医学。
山东中医药大学原为山东中医学院，创建于1958年，是新中国早期建立的中医药高等学府之一。1978年被确定为全国重点建设的中医院校，1981年成为山东省重点高校，1986年获得博士学位授予点，1996年更名为山东中医药大学。2007年学校主体搬迁至扁鹊故里长清。
科技驱动、协同创新，科研创新长足发展。学校连续两年首位获得国家科技进步二等奖。现有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，1个教育部重点实验室，6个国家中医药管理局三级重点实验室，3个国家中医药管理局重点研究室，2个全国学术流派传承工作室，其他省部级科研创新平台30个。拥有国家中医临床研究基地、国家重大新药创制平台（山东）中药单元平台。国家中医药管理局中医药特色疗法评价推广中心落户学校。先后建设海洋中药研究院（青岛中医药科学院）、中医药创新研究院、鲁澳中医药产业研究院、药物研究院（中医药健康产业技术研究院）、中医文献与文化研究院，成立全球首家石墨烯医学研究院、全国首家中医药抗病毒研究基地。现有实验室面积12.47万平方米，青岛中医药传承创新基地实验室面积3.27万平方米，教学科研仪器总值达10.18亿元。
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