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新疆农业职业技术大学开设的专业有：动物医学、现代畜牧、农业水利工程、食品工程技术、现代粮食工程技术、现代种业技术、设施园艺、广播影视节目制作、畜牧兽医、食品检验检测技术。
省级(直辖市)级特色专业：3个：计算机网络技术、农产品加工与质量检测、化工生物技术。
省重点、培育专业级特色专业：1个：农业装备应用技术。
新疆农业职业技术大学是一所公办本科层次职业院校，坐落于丝绸之路经济带核心区乌鲁木齐都市圈乌昌地区，2024年6月，经教育部批准以新疆农业职业技术学院为基础整合资源升格设立。学校前身是创建于1958年的昌吉农业学校，1988年隶属自治区农业厅改名为新疆农业学校，2000年升格为新疆农业职业技术学院，2008年与原自治区农业干部学校合并，整合为新的新疆农业职业技术学院。
学校联合政、行、校、企、科技园区共建覆盖现代农业全产业链的16个技术创新服务平台，创建“亚欧现代农业发展中心”“乡村振兴产业促进中心”等科技成果转化与技术服务平台。学校选育并审定拥有自主知识产权瓜菜新品种8个，参与玉米等新品种选育31个，审定授权专利118项，制定地方标准9项，开展新技术、新工艺、新产品开发16项。主持厅级及以上科研项目100余项。荣获自治区科技进步三等奖等6项。
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