南京理工大学第五轮学科评估完整结果目前尚未公开。作为参考，在教育部第四轮学科评估中，南京理工大学共有27个学科获得评级，兵器科学与技术获评A+，为学校评级最高的学科。
教育部第四轮学科评估中，南京理工大学一共27个学科上榜，其中1个A+学科、1个A-学科、4个B+学科、7个B学科、3个B-学科、5个C+学科、2个C学科、4个C-学科。
| 序号 | 院校名称 | 学科名称 | 评估结果 |
|---|---|---|---|
| 1 | 南京理工大学 | 兵器科学与技术 | A+ |
| 2 | 南京理工大学 | 化学工程与技术 | A- |
| 3 | 南京理工大学 | 机械工程 | B+ |
| 4 | 南京理工大学 | 光学工程 | B+ |
| 5 | 南京理工大学 | 控制科学与工程 | B+ |
| 6 | 南京理工大学 | 计算机科学与技术 | B+ |
| 7 | 南京理工大学 | 力学 | B |
| 8 | 南京理工大学 | 材料科学与工程 | B |
| 9 | 南京理工大学 | 电子科学与技术 | B |
| 10 | 南京理工大学 | 信息与通信工程 | B |
| 11 | 南京理工大学 | 环境科学与工程 | B |
| 12 | 南京理工大学 | 软件工程 | B |
| 13 | 南京理工大学 | 管理科学与工程 | B |
| 14 | 南京理工大学 | 马克思主义理论 | B- |
| 15 | 南京理工大学 | 数学 | B- |
| 16 | 南京理工大学 | 仪器科学与技术 | B- |
| 17 | 南京理工大学 | 动力工程及工程热物理 | C+ |
| 18 | 南京理工大学 | 安全科学与工程 | C+ |
| 19 | 南京理工大学 | 工商管理 | C+ |
| 20 | 南京理工大学 | 图书情报与档案管理 | C+ |
| 21 | 南京理工大学 | 设计学 | C+ |
| 22 | 南京理工大学 | 电气工程 | C |
| 23 | 南京理工大学 | 航空宇航科学与技术 | C |
| 24 | 南京理工大学 | 外国语言文学 | C- |
| 25 | 南京理工大学 | 物理学 | C- |
| 26 | 南京理工大学 | 化学 | C- |
| 27 | 南京理工大学 | 土木工程 | C- |
从评级较高的学科来看，南京理工大学的兵器科学与技术获评A+，化学工程与技术获评A-，机械工程、光学工程、控制科学与工程、计算机科学与技术获评B+，这些学科均为该校的优势学科。
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