东南大学第五轮学科评估完整结果目前还未公示。作为参考，在教育部第四轮学科评估中，东南大学共有28个学科获得评级，其中建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、艺术学理论获评A+，为学校评级最高的学科。
教育部第四轮学科评估中，东南大学一共28个学科上榜，其中5个A+学科、1个A学科、6个A-学科、9个B+学科、4个B学科、2个B-学科、1个C+学科。
| 序号 | 院校名称 | 学科名称 | 评估结果 |
|---|---|---|---|
| 1 | 东南大学 | 建筑学 | A+ |
| 2 | 东南大学 | 土木工程 | A+ |
| 3 | 东南大学 | 交通运输工程 | A+ |
| 4 | 东南大学 | 生物医学工程 | A+ |
| 5 | 东南大学 | 艺术学理论 | A+ |
| 6 | 东南大学 | 电子科学与技术 | A |
| 7 | 东南大学 | 仪器科学与技术 | A- |
| 8 | 东南大学 | 信息与通信工程 | A- |
| 9 | 东南大学 | 控制科学与工程 | A- |
| 10 | 东南大学 | 风景园林学 | A- |
| 11 | 东南大学 | 城乡规划学 | A- |
| 12 | 东南大学 | 管理科学与工程 | A- |
| 13 | 东南大学 | 哲学 | B+ |
| 14 | 东南大学 | 应用经济学 | B+ |
| 15 | 东南大学 | 机械工程 | B+ |
| 16 | 东南大学 | 电气工程 | B+ |
| 17 | 东南大学 | 动力工程及工程热物理 | B+ |
| 18 | 东南大学 | 计算机科学与技术 | B+ |
| 19 | 东南大学 | 化学工程与技术 | B+ |
| 20 | 东南大学 | 环境科学与工程 | B+ |
| 21 | 东南大学 | 软件工程 | B+ |
| 22 | 东南大学 | 光学工程 | B |
| 23 | 东南大学 | 材料科学与工程 | B |
| 24 | 东南大学 | 工商管理 | B |
| 25 | 东南大学 | 设计学 | B |
| 26 | 东南大学 | 力学 | B- |
| 27 | 东南大学 | 公共管理 | B- |
| 28 | 东南大学 | 测绘科学与技术 | C+ |
从评级较高的学科来看，东南大学的建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、艺术学理论获评A+，电子科学与技术获评A，仪器科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、风景园林学、城乡规划学等学科获评A-，这些学科均为该校的优势学科。
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