云南农业大学第五轮学科评估完整结果目前尚未公开。作为参考，在教育部第四轮学科评估中，云南农业大学共有9个学科获得评级，其中植物保护、畜牧学获评B，为学校评级最高的学科。
教育部第四轮学科评估中，云南农业大学一共9个学科上榜，其中2个B学科、1个C+学科、3个C学科、3个C-学科。
| 序号 | 院校名称 | 学科名称 | 评估结果 |
|---|---|---|---|
| 1 | 云南农业大学 | 植物保护 | B |
| 2 | 云南农业大学 | 畜牧学 | B |
| 3 | 云南农业大学 | 作物学 | C+ |
| 4 | 云南农业大学 | 食品科学与工程 | C |
| 5 | 云南农业大学 | 草学 | C |
| 6 | 云南农业大学 | 农业资源与环境 | C |
| 7 | 云南农业大学 | 科学技术史 | C- |
| 8 | 云南农业大学 | 农业工程 | C- |
| 9 | 云南农业大学 | 园艺学 | C- |
从评级较高的学科来看，云南农业大学的植物保护、畜牧学获评B，作物学获评C+，食品科学与工程、草学、农业资源与环境获评C，这些学科均为该校的优势学科。
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