新疆大学第五轮学科评估完整结果目前尚未公开。作为参考，在教育部第四轮学科评估中，新疆大学共有16个学科获得评级，其中马克思主义理论、数学获评B，为学校评级最高的学科。
教育部第四轮学科评估中，新疆大学一共16个学科上榜，其中2个B学科、5个B-学科、7个C+学科、2个C-学科。
| 序号 | 院校名称 | 学科名称 | 评估结果 |
|---|---|---|---|
| 1 | 新疆大学 | 马克思主义理论 | B |
| 2 | 新疆大学 | 数学 | B |
| 3 | 新疆大学 | 理论经济学 | B- |
| 4 | 新疆大学 | 中国语言文学 | B- |
| 5 | 新疆大学 | 化学 | B- |
| 6 | 新疆大学 | 计算机科学与技术 | B- |
| 7 | 新疆大学 | 化学工程与技术 | B- |
| 8 | 新疆大学 | 法学 | C+ |
| 9 | 新疆大学 | 地理学 | C+ |
| 10 | 新疆大学 | 生物学 | C+ |
| 11 | 新疆大学 | 生态学 | C+ |
| 12 | 新疆大学 | 机械工程 | C+ |
| 13 | 新疆大学 | 电气工程 | C+ |
| 14 | 新疆大学 | 软件工程 | C+ |
| 15 | 新疆大学 | 政治学 | C- |
| 16 | 新疆大学 | 新闻传播学 | C- |
从评级较高的学科来看，新疆大学的马克思主义理论、数学获评B，理论经济学、中国语言文学、化学、计算机科学与技术、化学工程与技术获评B-，法学、地理学、生物学、生态学、机械工程等学科获评C+，这些学科均为该校的优势学科。
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