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江西农业工程职业学院开设的专业有：现代物流管理、商务英语、大数据与会计、市场营销、电子商务、现代农业经济管理、动物医学、宠物医疗技术、畜牧兽医、宠物养护与驯导、畜禽智能化养殖、婴幼儿托育服务与管理、学前教育、数控技术、工业机器人技术、模具设计与制造、机电一体化技术、现代农业装备应用技术、机械设计与制造、电子信息工程技术、汽车检测与维修技术、工业过程自动化技术、现代农业技术、植物保护与检疫技术、园艺技术、园林工程技术、建筑工程技术、休闲农业经营与管理、工程造价、物联网应用技术、软件技术、计算机应用技术、计算机网络技术、室内艺术设计、虚拟现实技术应用、大数据技术、中医养生保健、中药学、中草药栽培与加工技术、中药制药、农产品加工与质量检测。
省级(直辖市)级特色专业：2个：园林工程技术、中草药栽培与加工技术。
江西农业工程职业学院是一所集农林、生物、工程、信息、财经、管理于一体的全日制公办普通高等职业学院，隶属江西省农业农村厅，受江西省教育厅指导。学院创办于1940年，前身是江西省樟树农业学校，1980年被确定为江西省重点中专，2000年被确定为首批国家级重点中专，2004年升格为高等职业学院。2014年经江西省人民政府批准，成为江西省农技人员定向培养学校（定向招生、定向培养、定向分配）。2016年经省教育厅批准，与井冈山大学联合培养应用技术型本科人才。2019年获批国家第二批1+X证书制度试点院校。 2020年被确定为江西省优质专科高等职业院校。2021年经省教育厅批准，与中医药大学联合培养“中药资源与开发”专业本科层次人才。
学院成人教育有学历教育(本科、专科、中专)与非学历教育两种形式。前者包括远程教育、函授教育、自学考试等。学校先后与华中农业大学、宜春学院、江西农业大学、中国农业大学等联合办学，成立了中国农业大学江西农业工程职业学院学习中心。非学历教育包括职业技能培训、鉴定、汽车驾驶员培训等。设有国家职业技能培训站与鉴定站（批准鉴定初、中、高级25个工种）、全国英语四六级考试考点、全国计算机等级考试考点和全国电子商务师资格考试等考点。
