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安徽医科大学开设的专业有：临床医学(精神医学方向)、临床医学(康复医学方向)、康复治疗学、临床医学、麻醉学、临床医学(“5+3”一体化)、临床医学(妇产科学方向)、临床医学(临床病理方向)、医学影像学、医学检验技术(中外合作办学)、医学检验技术、临床医学（5+3一体化）、麻醉学、康复治疗学、临床医学（5+3一体化，儿科学）、临床医学、儿科学、眼视光医学、食品卫生与营养学、卫生检验与检疫、预防医学、妇幼保健医学、食品质量与安全、劳动与社会保障、信息管理与信息系统、健康服务与管理、公共事业管理、中药学、药物制剂、临床药学、药学、医学信息工程、生物医学工程、智能医学工程、护理学、助产学、基础医学、放射医学、精神医学、应用心理学、生物技术、生物科学、临床医学（农村免费定向）、法学、口腔医学等。
国家级级特色专业：2个：预防医学、临床医学。
省级(直辖市)级特色专业：7个：生物技术、口腔医学、卫生检验与检疫、麻醉学、法学、临床医学、医学影像学。
学校现有梅山路、翡翠路、东校区和新医科中心（在建）等4个校区。在职教职医护员工（含直属附院）1.67万人，其中校本部职工1922人。拥有研究生学院、基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、卫生管理学院、药学院、护理学院、马克思主义学院、生命科学学院、生物医学工程学院、第一临床医学院、第二临床医学院、巢湖临床医学院、国际教育学院、人文医学学院、继续教育学院、第五临床医学院、精神卫生与心理科学学院、法学院、临床药理研究所等20个直属教学机构。拥有第一附属医院、第二附属医院、附属口腔医院、附属巢湖医院、附属阜阳医院等5所直属附属医院，另有安徽省公共卫生临床中心（安徽省传染病医院、第一附属医院北区）和6所共建附属医院、3所非直属附属医院、3所医学中心、3所附属疾病预防控制中心，医联体合作单位300余家，构建起覆盖全省、辐射周边、贯穿“全生命周期”的安医系健康服务体系。
学校坚持开门开放办学，坚持高质量发展，深入推进校地、校院和校企广泛合作，积极服务地方经济社会发展。主动对接长三角一体化战略布局，成为长三角医学教育联盟创始副主席单位。抢抓粤港澳大湾区新机遇，筹建安徽医科大学深圳研究院。加快融入合肥综合性国家科学中心，重点打造大健康研究院健康大数据与群体医学研究所等重大创新平台。采取“学院+中心”的产学研用一体化建设模式，积极推进新医科中心（新校区）项目建设，为推动我省医学教育创新、支撑大健康产业发展贡献重要力量。学校建有高质量的实践教学体系，拥有临床学院达50余所，实践教学基地90余所，分布于安徽省各地市及北京、上海、江苏、山东、浙江、广东、福建、新疆等省（市、自治区）。同美国、加拿大、德国、英国、俄罗斯、意大利、西班牙、瑞典、南非、加纳、埃塞俄比亚、澳大利亚、日本、韩国、马来西亚以及台湾地区等20个国家和地区的43所机构广泛开展合作交流与合作办学，双方互派专家学者、互派学生、相互交流信息资料、共同开展人才培养和科研合作。
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