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云南中医药大学开设的专业有：食品质量与安全、药学、药物制剂、中药资源与开发、中草药栽培与鉴定、食品科学与工程、中药学、制药工程、市场营销、健康服务与管理、应用心理学、公共事业管理、物流管理、针灸推拿学、中医养生学、康复治疗学、中医康复学、中医儿科学、中医学、中医骨伤科学、计算机科学与技术、医学信息工程、护理学、医学实验技术、傣医学等。
国家级级特色专业：2个：中药学、中医学。
省级(直辖市)级特色专业：5个：中医学、中药学、制药工程、针灸推拿学、中西医临床医学。
云南中医药大学是云南省政府与国家中医药管理局共建高校，是最早开展民族医药人才培养的高校，是首开中医药高等教育海外办学先河的高校，也是云南省唯一的中医药本科院校。
致力民族医药人才培养及学术科研，大力发展国际化教育推动中医药“走出去”是学校的两大鲜明特色。办学以来，学校扎根祖国西南边疆民族地区，开展具有云南地方特色的民族医药研究和人才培养，首次提出“民族医药学”概念，是最早开展民族医药人才培养的高等院校。构建了全国唯一的傣医学本、硕、博人才培养体系，建设了涵盖云南25个少数民族医药资源的数据库。建有云南省中医药民族医药博物馆，是国家三级博物馆、国家中医药文化宣传教育基地、全国科普教育基地。学校在创立民族医药学科、构建民族医药高等教育人才培养体系、构建民族医药传承创新平台、民族医药研究、传承民族医药文化、搭建民族医药学术交流平台等方面作出不可磨灭的贡献。立足云南辐射南亚东南亚区位优势，勇立开放潮头，不断发展推动“中医药”走出去。1990年，代表中国与西班牙实现政府间合作办学，建立“加泰罗尼亚－云南”中医学院，开创中医药高等教育海外办学先河，载入全国中医药高等教育60年史册。发起构建大湄公河次区域传统医药交流合作机制，建有世界唯一的中医西学博物馆，国际（西学）中医文化推广研究基地，独辟中医人类学研究，先后获批建设“中国－缅甸中医药中心”和“中国—老挝中医药中心”，在培养中医药国际人才、搭建国际学术交流平台开展国际联合科研和医疗服务等方面不断深化拓展，不断为共建“一带一路”、推动构建人类卫生健康共同体作出“云中贡献”。
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